¿Replicar estrategias de búsqueda en PubMed?

En Ciencia es indispensable poder replicar y reproducir un estudio científico. La idea es que aunque los resultados obtenidos no sean exactamente los mismos, sí lo sean las conclusiones a las que se llegan. Con las búsquedas bibliográficas realizadas en esos estudios debería pasar algo similar: es posible que los resultados varíen un poco, pero al reproducir la búsqueda bibliográfica sus resultados deberían llevarnos a las mismas conclusiones.

En mayo de 2020 se lanzó la nueva interfaz de PubMed que además de un nuevo diseño traía cambios en su algoritmo de búsqueda. Pues bien, este nuevo algoritmo viene con sorpresas. Cuando PubMed indexa un registro tiene varios campos para recoger las diferentes fechas asociadas a cada registro, desde la fecha en la que entró a PubMed, la fecha de publicación, la fecha en la que se le asignó descriptores MeSH, etc. Las revistas, además, varían en la forma en que la fecha de publicación aparece en un número. Algunas revistas incluyen sólo el año, mientras que otras incluyen el año más el mes más el día. Algunas revistas utilizan el año y la estación (por ejemplo invierno de 1999). La fecha de publicación sin mes se fijan en enero, los meses múltiples (por ejemplo abril-junio) se fijan en el primer mes, y las fechas sin día se fijan en el primer día del mes. Las fechas en las que aparece una estación se fijan como:

• Invierno = enero
• Primavera = abril
• Verano = julio
• Otoño = octubre

¿Cómo podemos buscar por fechas en PubMed?

En PubMed podemos buscar limitando por fecha de publicación utilizando la etiqueta [DP], que recoge tanto la fecha de publicación electrónica como la fecha de publicación impresa. Entre un tipo de publicación y otro pueden pasar días, meses e incluso más de un año. Cuando una revista deposita una cita para un artículo online first, la NLM añade la nota [Epub ahead of print] a la fecha de publicación en línea. Cuando el artículo se incluye en un número impreso, la cita se actualiza y se elimina esta nota. La fecha electrónica no se podrá buscar si es posterior a la fecha impresa.

Esto supone un problema cuando estamos replicando una búsqueda que se realizó, por ejemplo, para una revisión sistemática en enero de 2020. Si quisiéramos replicar esta búsqueda en el futuro, tendremos que limitar la búsqueda hasta final de enero de ese año para recuperar los mismos resultados que se obtuvieron aquella vez. El problema viene con la indexación de las fechas de publicación que hemos visto más arriba. Si hacemos la búsqueda limitando por fecha de publicación, recuperaremos aquellos artículos posteriores donde la fecha de publicación no lleve mes: sabemos que se les asigna por defecto el mes de enero del mismo año, por lo que entrarían dentro de nuestra búsqueda si bien no fueron publicados, por ejemplo, hasta junio de 2020.

Research note. Open letter to the users of the new PubMed: a critical appraisal.

Hace poco se publicó una Research Note que trataba este tema y alertaba a investigadores y documentalistas del problema que puede suponer la recuperación de artículos que durante la primera búsqueda de una revisión sistemática aún no existían. En esta nota se sugiere que además de la estrategia de búsqueda utilizada se acompañe del archivo compatible con gestores de referencias y que incluya los resultados obtenidos, de manera que se puedan comparar los resultados cuando se vaya a replicar la búsqueda.

Podéis leerla aquí: Research note. Open letter to the users of the new PubMed: a critical appraisal.

García-Puente, María; Pastor-Ramon, Elena; Agirre, Oskia; Morán, José-María; Herrera-Peco, Iván (2020). “Research note. Open letter to the users of the new PubMed: a critical appraisal”. Profesional de la información, v. 29, n. 3, e290336.

https://doi.org/10.3145/epi.2020.may.36

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